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不同来源的蛋白，内参的选择
不同来源的蛋白，内参的选择
Commonly Used Organelle Markers
· Fractions · | Markers |
Cytosol （胞浆蛋白） | Actin(42 KD),GAPDH(37 KD), Tubulin(50 KD), HSP90(90 KD) |
Nuclear （胞核蛋白） | Lamin-B1(75 KD，Nuclear envelope) HDAC1(55 KD，Nucleolar) SC-35(35 KD，Nuclear speckle) NUP98(100 KD, Nuclear pore), Histones? P84(84KD，Nuclear Matrix) |
Plasma Membrane （细胞膜蛋白/器膜蛋白） | Na/K-ATPase(100KD) Pan-cadherin(135 KD, Tissue specific express.) |
Mitochondria （线粒体） | Cytochrome C Reductase Core protein (53 KD) ATP5A(55 KD，inner membrane) Tomm20(20 KD, outer membrane) VDAC(Mito outer membrane, and PM) |
Endoplasmic reticulum (ER)（内质网） | Calreticulin (55 KD，lumen) Calnexin (68 KD, ER membrane, PM) |
Golgi Complex （高尔基复合体） | GM130(130 KD,Cis golgi matrix) Syntaxin 6 or Lamb2 (29 KD, Golgi membrane) |
Lysosome （溶酶体） | LAMP2(100 KD, lysosome, PM, Endosome) M6PR 274,(lysosome membrane) LIMPIl/lpg85(54KD, Lysosome membrane) |
Proteasome （蛋白酶体） | PSMC1(49KD) |
Endosome （内含体） | EEA1(170KD)
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Exosome （外泌体） | CD63(26KD)，Alix(96KD)，CD9(25KD)，CD81(26KD)
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Lipid Raft （脂筏） | Flotillin-1(47KD) |
内参的选择需要考虑实际的试验环境，比如某些细胞中，由于组织缺氧、糖尿病等因素会导致GAPDH的表达增高，不适合做内参。比如在在凋亡实验时，Lamin等也不适合作为内参。因此设计实验方案的时候应该考虑这些因素并查询相应文献，在实验过程中也应该注意如果内参表达出现异常，应考虑这方面因素。
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